هدف درس
در پایان این درس میتوانید بخشهای یک رکورد FASTQ را بشناسید و تفاوت توالی با کیفیت را توضیح دهید.
ساختار رکورد FASTQ
@read_001 ACGTACGT + IIIIIIII
خط اول شناسه خوانش، خط دوم توالی، خط سوم جداکننده و خط چهارم کاراکترهای کیفیت است. برای FASTQهای رایج با Phred+33، کاراکتر I به امتیاز کیفیت ۴۰ اشاره میکند.
تمرین کوتاه
تعداد بازهای این خوانش را مشخص کنید و بررسی کنید آیا تعداد کاراکترهای کیفیت با طول توالی برابر است.
گام بعدی: ویدئوی نمونه کنترل کیفیت و سپس پروژه تمرینی را ببینید.